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全基因組5hmC高通量檢測技術(shù),開啟疾病防治新篇章

全基因組5hmC高通量檢測技術(shù),開啟疾病防治新篇章

  • 2019-09-28 12:00:45

精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)——開啟腫瘤精準(zhǔn)治療新時(shí)代

2011年美國學(xué)界首先提出精準(zhǔn)醫(yī)療的概念,2015年美國啟動美國“精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃”,掀起了全球精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的熱潮,隨后英國、日本等國紛紛響應(yīng)成立專項(xiàng)研究,使其上升為國家層面的研究戰(zhàn)略,在我國,腫瘤精準(zhǔn)治療已被列為國家“十三五”重大科研研究規(guī)劃項(xiàng)目之一。

眾多研究者致力于臨床腫瘤與精準(zhǔn)治療的不斷探索。常見的如分子靶向藥物的應(yīng)用,通過對腫瘤患者的基因測序,根據(jù)驅(qū)動基因,選擇相應(yīng)的靶向治療藥物,從而提高惡性腫瘤的治療效果。

現(xiàn)階段基因測序主要為基因突變檢測,在臨床方面主要應(yīng)用于晚期癌癥患者的個(gè)體化用藥指導(dǎo),主要集中在EGFR、ALK、BRAF、BRCA等癌癥靶向治療相關(guān)的基因突變檢測,在這一領(lǐng)域,基因突變檢測作用巨大,并且應(yīng)用前景十分可觀,但是目前證實(shí)有明確的驅(qū)動基因突變的癌癥只占10%,絕大多數(shù)癌癥的基因突變機(jī)理尚不明確,因此僅通過檢測基因突變來癌癥早期檢測具有一定的局限性。癌癥的發(fā)生除了突變的基因作祟外,還需要環(huán)境等各種因素的協(xié)同作用及基因的表觀調(diào)控,這通常是一個(gè)長期的動態(tài)過程。

表觀遺傳學(xué)檢測——腫瘤早期篩查新手段

DNA是存在于細(xì)胞核內(nèi)的遺傳物質(zhì),它由4種堿基組成,不同的堿基序列組成DNA的遺傳信息。如果說一個(gè)樂曲有一個(gè)基本的樂譜,使用有限的幾種音符來書寫,并通過將這些音符進(jìn)行不同的排列,就譜成了不同樂曲,基因突變就可以比作為“樂譜”出錯(cuò),即堿基序列發(fā)生了錯(cuò)誤;表觀遺傳修飾相當(dāng)于“編曲”, 是對DNA表面上的一些蛋白或化學(xué)進(jìn)行修飾,在不改變DNA序列的前提下影響基因最終的表達(dá)模式。

換言之,表觀遺傳修飾相當(dāng)于人體第二道編碼。表觀遺傳學(xué)為基于非基因序列改變所致生理上基因表達(dá)水平的可遺傳變化,如DNA甲基化(5mC)羥甲基化(5hmC)、染色質(zhì)構(gòu)象變化、組蛋白修飾、小片段RNA和RNA修飾等。而近年來,越來越多的研究表明異常的表觀遺傳修飾會使基因錯(cuò)誤地表達(dá),引起代謝紊亂和疾病甚至腫瘤的發(fā)生,通過目前公認(rèn)的液體活檢方式,檢測外周血中表觀遺傳標(biāo)志物可達(dá)到檢測癌癥的目的。理論上,表觀遺傳學(xué)檢測能夠把所有的癌癥都在早期檢測到,特別是有高度異質(zhì)性的肝癌,所以在癌癥早篩和輔助診斷方面表觀遺傳學(xué)檢測有巨大的潛力且臨床前景明確。

5hmC——極具前景的表觀遺傳學(xué)腫瘤標(biāo)志物

肝癌患者在早期無明顯癥狀,甚至患病后較長時(shí)間毫無知覺,由于缺乏用于早期診斷的靈敏特異的生物標(biāo)志物,肝癌患者常常錯(cuò)過最佳治療期,臨床預(yù)后差,一般就診時(shí)已到中晚期,甚至已向肺部等處轉(zhuǎn)移。目前運(yùn)用傳統(tǒng)檢測手法,如AFP在肝癌早期診斷中的價(jià)值十分有限,有40%的早期肝癌患者無法被檢測出,這成為影響我國肝癌死亡率的重要原因。因此,尋找新型的、高效的肝癌早期篩查方式顯得尤為重要?;诒碛^遺傳學(xué)在癌癥早期篩查方面的特性,(5hmC)高通量檢測技術(shù)的發(fā)明,為解決這一問題帶來了新的可能。

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